MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 101098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018078	GCC	2	6	24262	24267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
502	NC_018078	GCTG	2	8	24296	24303	0 %	25 %	50 %	25 %	392430429
503	NC_018078	CGTAGT	2	12	24330	24341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392430429
504	NC_018078	CGGC	2	8	24344	24351	0 %	0 %	50 %	50 %	392430429
505	NC_018078	GAG	2	6	24375	24380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430429
506	NC_018078	GCC	3	9	24427	24435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
507	NC_018078	GCCG	2	8	24444	24451	0 %	0 %	50 %	50 %	392430429
508	NC_018078	CGGG	2	8	24519	24526	0 %	0 %	75 %	25 %	392430429
509	NC_018078	CTC	2	6	24556	24561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392430429
510	NC_018078	CCG	2	6	24596	24601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
511	NC_018078	GCC	2	6	24613	24618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
512	NC_018078	GCC	2	6	24637	24642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
513	NC_018078	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	392430429
514	NC_018078	AGG	2	6	24706	24711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430429
515	NC_018078	GCG	2	6	24726	24731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430429
516	NC_018078	C	6	6	24737	24742	0 %	0 %	0 %	100 %	392430429
517	NC_018078	CCTGGT	2	12	24768	24779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430429
518	NC_018078	GCC	2	6	24922	24927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
519	NC_018078	C	6	6	24943	24948	0 %	0 %	0 %	100 %	392430429
520	NC_018078	CCA	2	6	24980	24985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430429
521	NC_018078	GTC	2	6	25015	25020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430429
522	NC_018078	TCG	2	6	25028	25033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430429
523	NC_018078	GCCCCT	2	12	25038	25049	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	392430429
524	NC_018078	CGG	2	6	25144	25149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430429
525	NC_018078	CGA	2	6	25210	25215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430429
526	NC_018078	GAC	2	6	25228	25233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430429
527	NC_018078	ATG	2	6	25355	25360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430429
528	NC_018078	GCC	2	6	25412	25417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430429
529	NC_018078	GCA	2	6	25425	25430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430429
530	NC_018078	GC	3	6	26021	26026	0 %	0 %	50 %	50 %	392430430
531	NC_018078	CGC	2	6	26044	26049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430430
532	NC_018078	TTG	2	6	26050	26055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430430
533	NC_018078	CGG	2	6	26076	26081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430430
534	NC_018078	CGG	2	6	26118	26123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430430
535	NC_018078	GCA	2	6	26150	26155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430430
536	NC_018078	CTT	2	6	26181	26186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430430
537	NC_018078	GT	3	6	26255	26260	0 %	50 %	50 %	0 %	392430430
538	NC_018078	GTG	2	6	26300	26305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430430
539	NC_018078	GTC	2	6	26314	26319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430430
540	NC_018078	GCC	2	6	26327	26332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430430
541	NC_018078	AGC	2	6	26333	26338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430430
542	NC_018078	CGG	2	6	26406	26411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430430
543	NC_018078	CGG	2	6	26427	26432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430430
544	NC_018078	CGG	2	6	26460	26465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430430
545	NC_018078	CG	3	6	26489	26494	0 %	0 %	50 %	50 %	392430430
546	NC_018078	CGA	2	6	26505	26510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430430
547	NC_018078	CCA	2	6	26577	26582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430430
548	NC_018078	GCTC	2	8	26606	26613	0 %	25 %	25 %	50 %	392430430
549	NC_018078	CGG	2	6	26655	26660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430430
550	NC_018078	AGC	2	6	26741	26746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430430
551	NC_018078	TGA	2	6	26772	26777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430430
552	NC_018078	GCG	2	6	26801	26806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430430
553	NC_018078	CCAA	2	8	26823	26830	50 %	0 %	0 %	50 %	392430430
554	NC_018078	GCC	2	6	26845	26850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430430
555	NC_018078	CAGC	2	8	26889	26896	25 %	0 %	25 %	50 %	392430430
556	NC_018078	CCG	2	6	26900	26905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430430
557	NC_018078	CAC	2	6	26977	26982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430430
558	NC_018078	CAC	2	6	27166	27171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430431
559	NC_018078	CAG	2	6	27214	27219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430431
560	NC_018078	CGC	2	6	27255	27260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430431
561	NC_018078	GCA	2	6	27273	27278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430431
562	NC_018078	CGT	2	6	27279	27284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430431
563	NC_018078	GCC	2	6	27319	27324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430431
564	NC_018078	GCT	2	6	27393	27398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430431
565	NC_018078	GCG	2	6	27470	27475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430431
566	NC_018078	CGT	2	6	27486	27491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430431
567	NC_018078	CGGC	2	8	27709	27716	0 %	0 %	50 %	50 %	392430432
568	NC_018078	GGC	2	6	27767	27772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430432
569	NC_018078	CA	3	6	27829	27834	50 %	0 %	0 %	50 %	392430432
570	NC_018078	GCC	2	6	27872	27877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430432
571	NC_018078	CGC	2	6	27902	27907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430432
572	NC_018078	CGC	2	6	27938	27943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430432
573	NC_018078	CCG	2	6	27968	27973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430432
574	NC_018078	GTC	2	6	27984	27989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430432
575	NC_018078	CGA	2	6	28078	28083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430432
576	NC_018078	TC	3	6	28109	28114	0 %	50 %	0 %	50 %	392430432
577	NC_018078	GCC	2	6	28149	28154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430432
578	NC_018078	CCGG	2	8	28195	28202	0 %	0 %	50 %	50 %	392430432
579	NC_018078	CG	3	6	28234	28239	0 %	0 %	50 %	50 %	392430432
580	NC_018078	GC	3	6	28240	28245	0 %	0 %	50 %	50 %	392430432
581	NC_018078	GTC	2	6	28301	28306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430432
582	NC_018078	TCGGCG	2	12	28336	28347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392430432
583	NC_018078	CGA	2	6	28349	28354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430432
584	NC_018078	GC	3	6	28393	28398	0 %	0 %	50 %	50 %	392430432
585	NC_018078	TCG	2	6	28417	28422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430432
586	NC_018078	ACG	2	6	28441	28446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430432
587	NC_018078	GCA	2	6	28457	28462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430432
588	NC_018078	TCA	2	6	28498	28503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430433
589	NC_018078	CAC	2	6	28546	28551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430433
590	NC_018078	CTG	2	6	28565	28570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430433
591	NC_018078	GGC	2	6	28639	28644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430433
592	NC_018078	CTG	2	6	28653	28658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430433
593	NC_018078	TCA	2	6	28686	28691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430433
594	NC_018078	CGG	2	6	28721	28726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430433
595	NC_018078	CGA	2	6	28744	28749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430433
596	NC_018078	GCTC	2	8	28751	28758	0 %	25 %	25 %	50 %	392430433
597	NC_018078	ACC	2	6	28763	28768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430433
598	NC_018078	CGT	2	6	28811	28816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430433
599	NC_018078	GC	4	8	28828	28835	0 %	0 %	50 %	50 %	392430433
600	NC_018078	CGA	2	6	28859	28864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430433
601	NC_018078	ACG	2	6	28870	28875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430433
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603	NC_018078	TGCG	2	8	28890	28897	0 %	25 %	50 %	25 %	392430433
604	NC_018078	CGC	2	6	28987	28992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430433
605	NC_018078	CAC	2	6	29104	29109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430433
606	NC_018078	CCGG	2	8	29155	29162	0 %	0 %	50 %	50 %	392430433
607	NC_018078	CAA	2	6	29209	29214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430433
608	NC_018078	GTC	2	6	29219	29224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430433
609	NC_018078	CAA	2	6	29269	29274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430433
610	NC_018078	GGCAA	2	10	29402	29411	40 %	0 %	40 %	20 %	392430434
611	NC_018078	ACG	2	6	29413	29418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430434
612	NC_018078	GC	3	6	29461	29466	0 %	0 %	50 %	50 %	392430434
613	NC_018078	CGTC	2	8	29486	29493	0 %	25 %	25 %	50 %	392430434
614	NC_018078	CG	3	6	29523	29528	0 %	0 %	50 %	50 %	392430434
615	NC_018078	GGATCA	2	12	29534	29545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392430434
616	NC_018078	AGC	2	6	29602	29607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430434
617	NC_018078	GTC	2	6	29622	29627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430434
618	NC_018078	GCC	3	9	29628	29636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430434
619	NC_018078	CACG	2	8	29846	29853	25 %	0 %	25 %	50 %	392430435
620	NC_018078	ACCG	2	8	29927	29934	25 %	0 %	25 %	50 %	392430435
621	NC_018078	GGT	2	6	29945	29950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430435
622	NC_018078	CGC	2	6	30056	30061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430435
623	NC_018078	AGC	2	6	30083	30088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430435
624	NC_018078	GTC	2	6	30132	30137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430435
625	NC_018078	CGATC	2	10	30228	30237	20 %	20 %	20 %	40 %	392430435
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